Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HKR1P10072 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HKR1P10072 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HKR1P10072 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HKR1P10072 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HKR1P10072 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HKR1P10072 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HKR1P10072 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HKR1P10072 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HKR1P10072 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HKR1P10072 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HKR1P10072 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms