Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms