Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms