Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA2P0DJI9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms