Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFMP07197 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFMP07197 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFMP07197 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFMP07197 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFMP07197 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFMP07197 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFMP07197 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFMP07197 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFMP07197 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFMP07197 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFMP07197 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFMP07197 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFMP07197 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFMP07197 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFMP07197 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFMP07197 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFMP07197 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFMP07197 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFMP07197 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFMP07197 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFMP07197 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFMP07197 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFMP07197 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFMP07197 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEFMP07197 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEFMP07197 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFMP07197 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFMP07197 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFMP07197 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFMP07197 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFMP07197 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFMP07197 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFMP07197 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFMP07197 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFMP07197 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFMP07197 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFMP07197 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFMP07197 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFMP07197 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFMP07197 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFMP07197 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFMP07197 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFMP07197 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFMP07197 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFMP07197 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFMP07197 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFMP07197 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFMP07197 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFMP07197 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFMP07197 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFMP07197 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFMP07197 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFMP07197 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFMP07197 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFMP07197 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFMP07197 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFMP07197 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFMP07197 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFMP07197 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFMP07197 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFMP07197 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFMP07197 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFMP07197 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFMP07197 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFMP07197 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFMP07197 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFMP07197 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFMP07197 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFMP07197 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFMP07197 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFMP07197 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFMP07197 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFMP07197 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFMP07197 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFMP07197 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFMP07197 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFMP07197 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFMP07197 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFMP07197 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFMP07197 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFMP07197 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFMP07197 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFMP07197 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFMP07197 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFMP07197 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFMP07197 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFMP07197 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFMP07197 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFMP07197 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFMP07197 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFMP07197 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFMP07197 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFMP07197 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFMP07197 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFMP07197 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFMP07197 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFMP07197 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFMP07197 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFMP07197 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms