Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA3O96018 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA3O96018 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA3O96018 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA3O96018 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA3O96018 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA3O96018 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA3O96018 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA3O96018 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA3O96018 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA3O96018 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA3O96018 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA3O96018 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA3O96018 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA3O96018 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA3O96018 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA3O96018 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA3O96018 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA3O96018 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA3O96018 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA3O96018 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA3O96018 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA3O96018 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA3O96018 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA3O96018 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA3O96018 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA3O96018 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA3O96018 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA3O96018 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA3O96018 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APBA3O96018 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APBA3O96018 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APBA3O96018 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APBA3O96018 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APBA3O96018 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APBA3O96018 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APBA3O96018 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APBA3O96018 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APBA3O96018 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APBA3O96018 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APBA3O96018 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APBA3O96018 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APBA3O96018 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APBA3O96018 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APBA3O96018 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APBA3O96018 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APBA3O96018 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APBA3O96018 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
APBA3O96018 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APBA3O96018 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
APBA3O96018 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA3O96018 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA3O96018 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA3O96018 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA3O96018 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA3O96018 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA3O96018 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA3O96018 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA3O96018 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA3O96018 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA3O96018 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA3O96018 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA3O96018 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA3O96018 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA3O96018 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA3O96018 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA3O96018 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA3O96018 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA3O96018 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA3O96018 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA3O96018 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA3O96018 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA3O96018 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA3O96018 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA3O96018 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA3O96018 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA3O96018 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA3O96018 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA3O96018 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA3O96018 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA3O96018 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA3O96018 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA3O96018 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA3O96018 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA3O96018 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA3O96018 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA3O96018 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA3O96018 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA3O96018 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA3O96018 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA3O96018 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA3O96018 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA3O96018 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA3O96018 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA3O96018 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA3O96018 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA3O96018 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA3O96018 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA3O96018 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA3O96018 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms