Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
POLR1AO95602 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms