Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRPM2O94759 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRPM2O94759 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms