Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DYSFO75923 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DYSFO75923 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DYSFO75923 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms