Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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