Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF253O75346 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms