Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IGSF3O75054 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms