Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUBNO60494 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUBNO60494 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUBNO60494 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUBNO60494 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUBNO60494 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CUBNO60494 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUBNO60494 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUBNO60494 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUBNO60494 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUBNO60494 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUBNO60494 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUBNO60494 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUBNO60494 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUBNO60494 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CUBNO60494 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUBNO60494 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUBNO60494 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUBNO60494 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUBNO60494 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUBNO60494 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUBNO60494 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUBNO60494 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUBNO60494 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUBNO60494 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUBNO60494 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUBNO60494 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUBNO60494 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUBNO60494 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUBNO60494 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUBNO60494 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUBNO60494 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUBNO60494 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUBNO60494 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUBNO60494 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUBNO60494 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CUBNO60494 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CUBNO60494 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CUBNO60494 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CUBNO60494 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUBNO60494 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CUBNO60494 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUBNO60494 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CUBNO60494 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CUBNO60494 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUBNO60494 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CUBNO60494 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CUBNO60494 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CUBNO60494 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUBNO60494 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CUBNO60494 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUBNO60494 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUBNO60494 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CUBNO60494 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms