Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms