Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX16O60231 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX16O60231 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX16O60231 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX16O60231 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DHX16O60231 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DHX16O60231 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DHX16O60231 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DHX16O60231 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DHX16O60231 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DHX16O60231 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DHX16O60231 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DHX16O60231 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHX16O60231 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHX16O60231 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHX16O60231 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHX16O60231 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHX16O60231 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHX16O60231 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHX16O60231 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DHX16O60231 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHX16O60231 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHX16O60231 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHX16O60231 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHX16O60231 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHX16O60231 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHX16O60231 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHX16O60231 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHX16O60231 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX16O60231 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX16O60231 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX16O60231 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX16O60231 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX16O60231 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX16O60231 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX16O60231 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX16O60231 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX16O60231 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX16O60231 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX16O60231 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX16O60231 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX16O60231 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX16O60231 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX16O60231 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHX16O60231 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHX16O60231 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHX16O60231 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms