Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VGFO15240 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VGFO15240 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VGFO15240 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VGFO15240 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VGFO15240 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VGFO15240 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VGFO15240 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VGFO15240 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VGFO15240 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VGFO15240 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VGFO15240 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VGFO15240 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VGFO15240 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VGFO15240 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VGFO15240 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VGFO15240 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VGFO15240 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VGFO15240 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VGFO15240 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
VGFO15240 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
VGFO15240 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VGFO15240 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VGFO15240 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VGFO15240 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
VGFO15240 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VGFO15240 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VGFO15240 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VGFO15240 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VGFO15240 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
VGFO15240 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VGFO15240 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VGFO15240 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VGFO15240 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VGFO15240 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VGFO15240 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VGFO15240 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VGFO15240 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VGFO15240 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VGFO15240 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VGFO15240 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VGFO15240 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VGFO15240 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VGFO15240 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VGFO15240 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
VGFO15240 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VGFO15240 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VGFO15240 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
VGFO15240 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VGFO15240 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VGFO15240 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VGFO15240 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VGFO15240 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VGFO15240 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VGFO15240 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VGFO15240 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VGFO15240 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VGFO15240 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VGFO15240 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VGFO15240 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VGFO15240 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VGFO15240 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VGFO15240 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VGFO15240 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VGFO15240 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VGFO15240 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VGFO15240 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
VGFO15240 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VGFO15240 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VGFO15240 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VGFO15240 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VGFO15240 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VGFO15240 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VGFO15240 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VGFO15240 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
VGFO15240 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VGFO15240 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VGFO15240 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VGFO15240 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VGFO15240 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VGFO15240 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VGFO15240 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VGFO15240 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
VGFO15240 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VGFO15240 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
VGFO15240 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
VGFO15240 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VGFO15240 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VGFO15240 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VGFO15240 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VGFO15240 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VGFO15240 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VGFO15240 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VGFO15240 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VGFO15240 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VGFO15240 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VGFO15240 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VGFO15240 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VGFO15240 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VGFO15240 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
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