Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms