Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1AO15047 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1AO15047 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1AO15047 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1AO15047 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1AO15047 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1AO15047 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1AO15047 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1AO15047 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SETD1AO15047 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SETD1AO15047 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SETD1AO15047 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SETD1AO15047 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SETD1AO15047 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
SETD1AO15047 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SETD1AO15047 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SETD1AO15047 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
SETD1AO15047 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SETD1AO15047 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD1AO15047 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms