Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms