Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms