Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F3O00716 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F3O00716 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms