Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SUPT5HO00267 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms