Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-1B6SEH8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms