Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms