Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD3A6NKT7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms