Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM3A6NDB9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms