Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms