Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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