Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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