Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA4CQ9C0C4 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEMA4CQ9C0C4 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms