Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CLN3Q13286 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CLN3Q13286 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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