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| NCOA4 | Q13772 | RNA5SP236-201 | ENST00000516169 | 116 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| NCOA4 | Q13772 | RNU6-113P-201 | ENST00000516653 | 101 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | HELZ-201 | ENST00000358691 | 13810 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| NCOA4 | Q13772 | SLC8A1-207 | ENST00000406785 | 20987 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | AC079466.2-201 | ENST00000585394 | 185 nt | TSL 5 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| NCOA4 | Q13772 | MARCH7-202 | ENST00000409175 | 2402 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| NCOA4 | Q13772 | POSTN-209 | ENST00000541179 | 3214 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.86 | | |
| NCOA4 | Q13772 | AL021368.2-201 | ENST00000606125 | 5352 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.86 | | |
| NCOA4 | Q13772 | LINC00645-203 | ENST00000557399 | 3512 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.86 | | |
| NCOA4 | Q13772 | CEP57L1-201 | ENST00000359793 | 2515 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.86 | | |
| NCOA4 | Q13772 | KTN1-203 | ENST00000395309 | 4021 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.86 | | |
| NCOA4 | Q13772 | SNORD56.3-201 | ENST00000363507 | 71 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | SNORD77.3-201 | ENST00000391113 | 65 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| NCOA4 | Q13772 | Y_RNA.649-201 | ENST00000459077 | 103 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | FANCD2-213 | ENST00000625535 | 117 nt | TSL 5 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | AC093010.3-201 | ENST00000570269 | 15214 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | RNU6-23P-201 | ENST00000363283 | 107 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | DEFB119-202 | ENST00000376315 | 324 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| NCOA4 | Q13772 | AC007064.1-201 | ENST00000412238 | 351 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| NCOA4 | Q13772 | AC091133.1-201 | ENST00000435491 | 483 nt | TSL 3 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| NCOA4 | Q13772 | LINC01203-202 | ENST00000456091 | 476 nt | TSL 3 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| NCOA4 | Q13772 | TRBV12-1-201 | ENST00000479785 | 344 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| NCOA4 | Q13772 | RN7SL297P-201 | ENST00000483161 | 293 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| NCOA4 | Q13772 | AC006483.1-201 | ENST00000487308 | 313 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| NCOA4 | Q13772 | MIR3613-201 | ENST00000579844 | 87 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| NCOA4 | Q13772 | MIR5197-201 | ENST00000583721 | 112 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| NCOA4 | Q13772 | AC006441.5-201 | ENST00000612680 | 209 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| NCOA4 | Q13772 | CLRN1-AS1.1-201 | ENST00000615643 | 79 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| NCOA4 | Q13772 | DOPEY1-203 | ENST00000369739 | 7743 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| NCOA4 | Q13772 | LPP-220 | ENST00000617246 | 18220 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| NCOA4 | Q13772 | NEB-218 | ENST00000603639 | 25578 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| NCOA4 | Q13772 | NEB-219 | ENST00000604864 | 25578 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| NCOA4 | Q13772 | NBEAL1-203 | ENST00000449802 | 10938 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| NCOA4 | Q13772 | MIR148B-201 | ENST00000362252 | 99 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| NCOA4 | Q13772 | RNA5SP383-201 | ENST00000362934 | 120 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| NCOA4 | Q13772 | RNU6-1164P-201 | ENST00000364428 | 107 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| NCOA4 | Q13772 | MIR548O-201 | ENST00000408583 | 114 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| NCOA4 | Q13772 | SNORA11.4-201 | ENST00000408823 | 129 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |