Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL4BQ13620 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
CUL4BQ13620 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL4BQ13620 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL4BQ13620 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL4BQ13620 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL4BQ13620 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL4BQ13620 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL4BQ13620 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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