Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MTMR3Q13615 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MTMR3Q13615 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MTMR3Q13615 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MTMR3Q13615 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MTMR3Q13615 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MTMR3Q13615 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MTMR3Q13615 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MTMR3Q13615 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.4 ms