Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
SF3B2Q13435 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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