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| ADAM9 | Q13443 | RNU6-561P-201 | ENST00000516222 | 102 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | RNU6-971P-201 | ENST00000516920 | 106 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
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| ADAM9 | Q13443 | RNU6-586P-201 | ENST00000517265 | 104 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
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| ADAM9 | Q13443 | AC010154.1-201 | ENST00000425857 | 269 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
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| ADAM9 | Q13443 | CHD9-202 | ENST00000398510 | 11337 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
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| ADAM9 | Q13443 | TAB2-201 | ENST00000367456 | 4553 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
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| ADAM9 | Q13443 | Y_RNA.127-201 | ENST00000363386 | 109 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
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| ADAM9 | Q13443 | ANP32E-209 | ENST00000616917 | 2989 nt | TSL 2 BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | TUG1_4.1-201 | ENST00000619464 | 181 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | AC006435.5-201 | ENST00000624486 | 112 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | MIR6844-201 | ENST00000637122 | 62 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | PCDH11Y-201 | ENST00000215473 | 4595 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | ZNF280D-204 | ENST00000558320 | 3666 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | ZMYM1-201 | ENST00000359858 | 4175 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | OGN-202 | ENST00000375561 | 2743 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | Y_RNA.71-201 | ENST00000362892 | 104 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | Y_RNA.218-201 | ENST00000364218 | 104 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | SNORD56.5-201 | ENST00000364281 | 72 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | RNU6-438P-201 | ENST00000365561 | 103 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | Y_RNA.393-201 | ENST00000383936 | 102 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | Y_RNA.521-201 | ENST00000384560 | 114 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | Y_RNA.542-201 | ENST00000384641 | 111 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | RNU6-768P-201 | ENST00000384683 | 107 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | FO393413.1-201 | ENST00000402892 | 195 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | AC008134.1-201 | ENST00000420943 | 193 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | RNU7-197P-201 | ENST00000458836 | 62 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | SNORD109B-201 | ENST00000458961 | 67 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | SNORD109A-201 | ENST00000459128 | 67 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | RNU6-1211P-201 | ENST00000459179 | 105 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | AC096725.1-201 | ENST00000514266 | 313 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | RNA5SP282-201 | ENST00000516355 | 108 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | AC027419.1-201 | ENST00000522976 | 328 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | MIR3117-201 | ENST00000584034 | 78 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | AL356280.1-201 | ENST00000603614 | 379 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | 5S_rRNA.13-201 | ENST00000622298 | 123 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | HS1BP3-208 | ENST00000631166 | 78 nt | TSL 5 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | SLCO1B3-201 | ENST00000261196 | 2840 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| ADAM9 | Q13443 | TSGA10-205 | ENST00000410001 | 3036 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.96 | | |
| ADAM9 | Q13443 | ERBIN-202 | ENST00000380935 | 6692 nt | TSL 5 BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| ADAM9 | Q13443 | RNU6-674P-201 | ENST00000363831 | 107 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| ADAM9 | Q13443 | SNORD116-14-201 | ENST00000383894 | 92 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| ADAM9 | Q13443 | SNORD116-17-201 | ENST00000383929 | 92 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| ADAM9 | Q13443 | SNORD116-15-201 | ENST00000384445 | 92 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| ADAM9 | Q13443 | SNORD116-19-201 | ENST00000384729 | 92 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| ADAM9 | Q13443 | RNA5SP496-201 | ENST00000391240 | 109 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| ADAM9 | Q13443 | RNU2-63P-201 | ENST00000410792 | 194 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| ADAM9 | Q13443 | KRTAP25-1-201 | ENST00000416044 | 370 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| ADAM9 | Q13443 | AC116666.1-201 | ENST00000453915 | 551 nt | TSL 5 BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| ADAM9 | Q13443 | CKS1BP2-201 | ENST00000497342 | 240 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| ADAM9 | Q13443 | AC074131.1-201 | ENST00000514662 | 253 nt | TSL 2 BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| ADAM9 | Q13443 | RNU6-1333P-201 | ENST00000516162 | 93 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| ADAM9 | Q13443 | AC025647.1-201 | ENST00000517879 | 253 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| ADAM9 | Q13443 | AC004148.1-201 | ENST00000571506 | 398 nt | TSL 5 BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| ADAM9 | Q13443 | MIR4435-1-201 | ENST00000582552 | 80 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| ADAM9 | Q13443 | AL359881.1-201 | ENST00000602916 | 267 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| ADAM9 | Q13443 | AC010297.1-201 | ENST00000623948 | 149 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| ADAM9 | Q13443 | ASPN-202 | ENST00000375544 | 2470 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| ADAM9 | Q13443 | TMEM232-201 | ENST00000455884 | 2501 nt | APPRIS P2 TSL 2 BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| ADAM9 | Q13443 | ZNF702P-202 | ENST00000434269 | 1966 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| ADAM9 | Q13443 | ARHGAP28-204 | ENST00000419673 | 5492 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |