Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NR1H3Q13133 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NR1H3Q13133 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NR1H3Q13133 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NR1H3Q13133 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NR1H3Q13133 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NR1H3Q13133 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NR1H3Q13133 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NR1H3Q13133 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NR1H3Q13133 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NR1H3Q13133 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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