Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DUSP4Q13115 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DUSP4Q13115 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DUSP4Q13115 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DUSP4Q13115 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DUSP4Q13115 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DUSP4Q13115 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
DUSP4Q13115 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
DUSP4Q13115 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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