Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK2Q13002 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 240.9 ms