Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
E2F4Q16254 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
E2F4Q16254 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
E2F4Q16254 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
E2F4Q16254 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
E2F4Q16254 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
E2F4Q16254 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
E2F4Q16254 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
E2F4Q16254 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
E2F4Q16254 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
E2F4Q16254 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
E2F4Q16254 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
E2F4Q16254 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
E2F4Q16254 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
E2F4Q16254 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
E2F4Q16254 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms