Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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