Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TOP3AQ13472 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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