Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms