Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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