Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
CHRNEQ04844 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms