Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PKD2Q13563 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PKD2Q13563 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PKD2Q13563 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PKD2Q13563 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PKD2Q13563 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PKD2Q13563 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PKD2Q13563 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1159.3 ms