Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NR1H3Q13133 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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