Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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FOXD1Q16676 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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FOXD1Q16676 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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FOXD1Q16676 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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FOXD1Q16676 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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FOXD1Q16676 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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FOXD1Q16676 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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FOXD1Q16676 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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