Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN4PQ13434 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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