Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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